| 背景概述
感染性疾?。ㄒ卜Q感染?。┦侨虬l(fā)病率和死亡率最高的疾病之一。病原體感染的復(fù)雜多樣,新發(fā)病原體的不斷涌現(xiàn),細菌耐藥的嚴峻形勢,老傳染病死灰復(fù)燃等,給感染性疾病防控診療帶來了巨大挑戰(zhàn)。在臨床診療方面,約有20-60%的重癥肺炎,發(fā)熱待查,膿毒血癥和中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染患者不能明確感染病原體,造成嚴重的醫(yī)療,經(jīng)濟和社會負擔(dān)。因此,快速、準確的病原體鑒定是有效治療、病情監(jiān)測和控制疾病蔓延的重要前提!
傳統(tǒng)的病原微生物檢測方法主要包括形態(tài)學(xué)檢測、培養(yǎng)分離、生化檢測、免疫學(xué)和核酸檢測。因操作簡單、快速、技術(shù)要求不高,同時具有一定的診斷敏感性和特異性,目前仍在臨床上廣泛使用。但傳統(tǒng)的檢測方法在敏感性、特異性、時效性、信息量等方面存在局限,而且對于未知或者罕見的病原微生物,無法快速識別。
宏基因組測序(metagenomics next generation sequencing, mNGS)技術(shù)不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng),直接對全血、肺泡灌洗液、腦脊液等臨床標(biāo)本中的核酸進行高通量測序,通過與微生物參考序列數(shù)據(jù)庫進行比對分析,獲得疑似致病微生物的種屬信息。mNGS無需特異性擴增,無偏向性地快速鑒定細菌、真菌、病毒和寄生蟲等病原體,在未知或罕見病原體鑒定、耐藥基因譜分析、混合病原菌感染檢測等方面展現(xiàn)出廣闊的應(yīng)用前景,尤其適用于急危重癥和疑難感染的診斷。
| 服務(wù)內(nèi)容
檢測范圍:采用mNGS技術(shù)對臨床標(biāo)本核酸進行廣譜的病原微生物篩查,可檢測范圍包括基因組序列已知的12818+種微生物,包括細菌(含分枝桿菌、支原體/衣原體)、真菌 、DNA病毒、寄生蟲等。
可檢測病原體種類 |
種類數(shù)目 |
---|---|
細菌 |
6600+ |
真菌 |
986+ |
DNA病毒 |
2303+ |
RNA病毒 |
2707+ |
寄生蟲 |
222+ |
合計 |
12818+ |
檢測適應(yīng)癥:
① 疑“難”:長期不明原因發(fā)熱,感染病因不明;
② ?!爸亍保褐匕Y肺炎、腦膜炎,膿毒血癥等;
③ “特”殊:器官移植、腫瘤患者、免疫缺陷患者等特殊人群;
| 檢測周期
自實驗室收到標(biāo)本確認合格后,1-2個工作日出具檢測報告
| 檢測優(yōu)勢/適用人群
產(chǎn)品優(yōu)勢:
1、 自主開發(fā),專業(yè)分析,權(quán)威解讀
1) 自主開發(fā)的核酸提取試劑盒,覆蓋多種標(biāo)本類型,可實現(xiàn)微生物的高效提?。?
2) 自主開發(fā)的宏基因組信息分析軟件,實現(xiàn)高效專業(yè)的生信分析,采用雙重人工復(fù)核,高校辨別真假陽性病原體;
3) 綜合參考多個權(quán)威數(shù)據(jù)庫和大量的文獻資料,建立微生物參考序列和微生物致病信息解讀兩大專業(yè)數(shù)據(jù)庫和解讀報告軟件,實現(xiàn)病原微生物的快速識別和解讀;
2、兩大平臺,強強聯(lián)合,準確可靠
NGS+qPCR兩大平臺,強強聯(lián)合,互相驗證,提高陽性檢出率和準確性。
| 樣本類型
標(biāo)本類型 |
標(biāo)本體積 |
儲存及運輸條件 |
---|---|---|
外周血 |
3-5ml |
常溫(15-25℃)保存及運輸,2天內(nèi)送檢 |
肺泡灌洗液 |
3ml以上 |
DNA檢測:-20℃保存1周,-80℃長期保存,避免反復(fù)凍融;冰袋/干冰運輸。 RNA檢測:-80℃保存,避免反復(fù)凍融;添加保存液,2-8℃冰袋運輸。 |
腦脊液 |
3ml以上 |
|
尿液 |
10ml |
|
其他體液 |
3ml以上 |
|
實體組織 |
綠豆大小 |