導(dǎo)航欄
首先簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),IU/ml和copies/ml是沒(méi)有直接關(guān)系的,IU/ml是國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的表述單位,copies/ml是各檢測(cè)方法對(duì)結(jié)果的表述單位的一種,可參見李金明《實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)》P177。所謂的International Unit(IU),是為了統(tǒng)一各個(gè)檢測(cè)方法而設(shè)定的單位。本身PCR檢測(cè)的拷貝數(shù)是無(wú)法絕對(duì)定量的,可以理解為,為了統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),WHO制定標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),賦予其IU值,發(fā)放給各個(gè)PCR試劑廠商,讓他們把各自檢測(cè)結(jié)果和標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)比較,從而得出各自的換算系數(shù)。比如分發(fā)的是1IU的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),羅氏測(cè)的是2copy,那羅氏的換算系數(shù)是2(2copies=1 IU),雅培的是20copy,那雅培的就是20(20copies=1 IU),由此可見,各個(gè)方法的轉(zhuǎn)換系數(shù)是不一樣的。其次,因?yàn)楦鲗?shí)驗(yàn)方法檢測(cè)結(jié)果的表述單位存在多樣化,如copies/ml,geq/ml等,使得檢測(cè)結(jié)果沒(méi)有可比性,因而WHO應(yīng)用國(guó)際單位IU作為統(tǒng)一的表述單位,使不同實(shí)驗(yàn)室、不同檢測(cè)方法得出的檢測(cè)結(jié)果的表述單位得到統(tǒng)一并具有了可比性。最后,具體每種方法的檢測(cè)結(jié)果與IU的關(guān)系,可以通過(guò)同時(shí)檢測(cè)WHO的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),然后根據(jù)其與標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的比例關(guān)系,來(lái)找到不同檢測(cè)方法IU與copies之間的關(guān)系。
采用Levey-Jerming質(zhì)控圖, 以X±2SD警告線,X±3SD為失控線。質(zhì)控點(diǎn)落在x±3S之外時(shí),首先采取的措施是復(fù)檢,復(fù)檢的目的主要是用于查明人為誤差,也可以查出偶然誤差,如果是偶然誤差,重測(cè)的結(jié)果應(yīng)在允許范圍內(nèi)。同時(shí)還在觀察標(biāo)準(zhǔn)曲線的生成情況,擴(kuò)增效率的高低,曲線梯并是否良好,曲線形態(tài)是否標(biāo)準(zhǔn),Ct值是否有飄移,還要結(jié)合臨床標(biāo)本的檢測(cè)結(jié)果,是否有高值和低值,來(lái)區(qū)分是試劑造成的失控還是操作不當(dāng)、儀器故障或老化造成的失控。若臨床標(biāo)本測(cè)定結(jié)果的曲線標(biāo)準(zhǔn),測(cè)量值有高有低,同時(shí)檢測(cè)的試劑空白及陰性質(zhì)控均在控,很有可能是標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)量有問(wèn)題,如降解、更換試劑型號(hào)等情況發(fā)生造成的。 對(duì)于連續(xù)7個(gè)質(zhì)控點(diǎn)落在均值之一側(cè),若均未超出X±3s范圍時(shí),認(rèn)為存在系統(tǒng)誤差,但檢測(cè)結(jié)果仍可發(fā)出;若連續(xù)7個(gè)質(zhì)控點(diǎn)落在均值之一側(cè),而且質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)有超出X±3s范圍的趨勢(shì)時(shí)(逐漸升高或逐漸降低),一定要聯(lián)絡(luò)儀器工程師,及時(shí)校準(zhǔn)儀器。
(1)實(shí)驗(yàn)室整體布局:根據(jù)衛(wèi)生部頒發(fā)的《臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室管理暫行辦法》(衛(wèi)醫(yī)發(fā)[2002]10號(hào))要求,臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)室原則上分為四個(gè)單獨(dú)的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū),標(biāo)本制備區(qū),擴(kuò)增區(qū),產(chǎn)物分析區(qū),也可以將后兩個(gè)區(qū)域合為一個(gè)區(qū),即擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)。實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)時(shí)按照《辦法》規(guī)定,三個(gè)區(qū)域相互獨(dú)立,并有各自的緩沖區(qū)域。
(2)各工作區(qū)域儀器設(shè)備各工作區(qū)域的儀器設(shè)備及物品,包括椅子、辦公用品、清潔用品等均不能拿出本區(qū)域,所有可移動(dòng)物品均應(yīng)有本區(qū)域的標(biāo)示。
各區(qū)域應(yīng)具備的設(shè)備配置為:屋頂紫外燈、近臺(tái)紫外燈、一次性手套、一次性鞋套、工作服、廢液缸、掃帚、拖把、廢紙簍、微量加樣器(覆蓋1-1000ul),經(jīng)高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾芯)、筆、紙等。各工作區(qū)域的特殊配置包括:
(1)試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū):2~8℃冰箱、漩渦震蕩器、超凈工作臺(tái)。
(2)標(biāo)本制備:2~8℃冰箱、-20℃冰箱、高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)、漩渦震蕩器、金屬加熱模塊、超凈工作臺(tái)。
(3)擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū):熒光定量核酸擴(kuò)增儀、電腦、打印機(jī)。
同時(shí):進(jìn)入各工作區(qū)域必須嚴(yán)格按照單一流向,并用明顯的箭頭表示,各區(qū)域用不同的顏色以示區(qū)別。即試劑貯存和設(shè)備區(qū)(藍(lán)色)→標(biāo)本制備區(qū)(白色)→擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)(粉色)。
1、儀器使用的廣泛程度
如果不是一個(gè)新出現(xiàn)的儀器品牌,為保證所購(gòu)置的儀器有充分的可靠性,臨床PCR實(shí)驗(yàn)室可以從相應(yīng)儀器在國(guó)內(nèi)外使用的廣泛程度來(lái)判斷。應(yīng)用越是廣泛的儀器,越是經(jīng)過(guò)實(shí)踐驗(yàn)證的,也就越具有可靠性。
2、儀器的檢測(cè)通量(反應(yīng)孔數(shù))
在購(gòu)買定量PCR儀的時(shí)候需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的要求來(lái)選擇不同通量的儀器。目前市面上的熒光定量PCR儀的檢測(cè)通量小到16多到384孔,實(shí)驗(yàn)室可以根據(jù)自己的檢測(cè)項(xiàng)目和發(fā)展?fàn)顩r,選擇合適的儀器,沒(méi)必要追求最昂貴的儀器,一般來(lái)說(shuō),96孔的通量足夠用了;如需尋找新藥靶點(diǎn)和疾病標(biāo)記等類型的實(shí)驗(yàn),則可以考慮購(gòu)買384孔的儀器。
3、儀器的通道數(shù)量
隨著醫(yī)院開展的項(xiàng)目越來(lái)越多,比如基因表達(dá),單核苷酸多態(tài)性分析、高分辨率熔解曲線等,那么單通道的儀器則無(wú)法滿足實(shí)驗(yàn)室的需求了,而多通道的設(shè)計(jì)則能使其更方便地檢測(cè)多重PCR檢測(cè)及其衍生的基因表達(dá)等其他分析模式。
4、耗材的開放性
耗材如擴(kuò)增反應(yīng)管的開放性可能會(huì)決定日常檢測(cè)成本的高低。作為臨床PCR實(shí)驗(yàn)室,在選擇實(shí)時(shí)熒光PCR儀時(shí),可考慮這一點(diǎn)。不過(guò)對(duì)于檢測(cè)HCV等RNA項(xiàng)目的時(shí)候,盡量使用去RNAnase酶耗材。
5、硬件設(shè)計(jì)特點(diǎn)
熒光定量PCR儀主要有96孔板式和離心式等,每種設(shè)計(jì)都有它的獨(dú)到之處,但也都有無(wú)法避免的缺陷。
96孔板的熒光定量PCR儀可以容納的樣本量大,最大可至100ul,而且無(wú)需特殊的耗材。傳統(tǒng)的96孔板儀器多采用鹵鎢燈激發(fā)、CCD檢測(cè)。其優(yōu)點(diǎn)在于:鹵鎢燈的光強(qiáng)比LED燈強(qiáng),波長(zhǎng)范圍廣,對(duì)于熒光染料的激發(fā)具有非常好的效果,性能比較穩(wěn)定,使用壽命約3000個(gè)小時(shí)左右;但CCD的檢測(cè)通常會(huì)因?yàn)槊總€(gè)樣品孔距光源和檢測(cè)器的光程各不相同,會(huì)產(chǎn)生邊緣效應(yīng),對(duì)結(jié)果產(chǎn)生一定的影響。為了保證精確、精準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這類儀器在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中通常需要配合ROX校正染料,來(lái)平衡孔間差異;離心式的儀器通常選用LED激發(fā)、PMT檢測(cè),設(shè)計(jì)上避免了邊緣效應(yīng),同時(shí)PMT檢測(cè)對(duì)熒光信號(hào)可以放大或縮小,相對(duì)于CCD檢測(cè)更加靈活,靈敏度更高;但LED的熒光強(qiáng)度比較弱,波長(zhǎng)范圍也比較窄,因此,對(duì)熒光染料的激發(fā)效果不如鹵鎢燈;
6、運(yùn)行速度
在熒光定量PCR儀的眾多技術(shù)參數(shù)中,升降溫速度也是非常重要的。更快的升降溫,可以縮短反應(yīng)進(jìn)行的時(shí)間,而且縮短了可能的非特異性結(jié)合和反應(yīng)時(shí)間,提高PCR的特異性。但是,運(yùn)行速度越快,對(duì)加熱制冷模塊的要求越高,因此,穩(wěn)定性是其存在的最大問(wèn)題,如果在市面上經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期考證的,穩(wěn)定性好的儀器,運(yùn)行速度越快,帶來(lái)的便捷越多;
7、靈活性
在儀器基本性能得到保證的情況下,另外一方面則需要考慮儀器的靈活性,主要包括:儀器運(yùn)輸?shù)撵`活性,拆卸的靈活性,軟件升級(jí)的靈活性,模塊更換的靈活性以及使用的靈活性等。
現(xiàn)在臨床PCR實(shí)驗(yàn)室使用的試劑大部分都是各生產(chǎn)企業(yè)提供的商品化的試劑盒,那么試劑質(zhì)量的好壞直接決定了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的好壞,而不同廠家試劑的性能、質(zhì)量和價(jià)格千差萬(wàn)別,如何選擇一款合適的試劑對(duì)每個(gè)PCR實(shí)驗(yàn)室都至關(guān)重要,一般來(lái)說(shuō),選擇試劑主要從以下幾個(gè)方面進(jìn)行評(píng)價(jià):
1、重復(fù)性
首先,試劑檢測(cè)結(jié)果的重復(fù)性直接展現(xiàn)了試劑的方法學(xué)及其質(zhì)量的好壞,是評(píng)價(jià)試劑好壞最明顯、最直接的指標(biāo)。
其次,必一運(yùn)動(dòng)在此說(shuō)的試劑重復(fù)性是指對(duì)原始樣本檢測(cè)的重復(fù)性,而不是對(duì)某一個(gè)樣本提取的核酸進(jìn)行重復(fù)性的檢測(cè)和評(píng)價(jià)。
最后,試劑的重復(fù)性對(duì)于療效檢測(cè)、用藥指導(dǎo)有著重大的意義,一個(gè)重復(fù)性好的試劑,往往能夠在病人的抗病毒治療過(guò)程中,給醫(yī)生和病人提供最直接、最可靠的數(shù)據(jù),讓醫(yī)生和病人對(duì)疾病進(jìn)展有更清楚的認(rèn)識(shí),從而制定合理的治療方案,實(shí)現(xiàn)更好的治療效果。
2、靈敏度
一個(gè)試劑的靈敏度往往能夠體現(xiàn)該試劑的技術(shù)水平和先進(jìn)程度,同時(shí)對(duì)于臨床病癥的監(jiān)測(cè)有著舉足輕重的意義。以乙肝為例來(lái)說(shuō),我國(guó)的乙肝復(fù)發(fā)率遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于發(fā)達(dá)國(guó)家,同時(shí)由乙肝病毒感染轉(zhuǎn)換為慢性肝炎、肝硬化、肝癌的患者也居世界前列,這很大程度上與對(duì)低載量病毒監(jiān)控的嚴(yán)重不足有關(guān)。美國(guó)肝病學(xué)會(huì)專家組就提出,對(duì)乙肝抗病毒治療過(guò)程中,HBV DNA的最低監(jiān)測(cè)點(diǎn)應(yīng)設(shè)置為10IU/ml,而歐洲和亞太肝病學(xué)也指出HBV DNA病毒載量應(yīng)該盡可能小于10IU/ml。這都足以證明,高靈敏度對(duì)于用藥治療、病程監(jiān)控等起著巨大的作用,靈敏度越高,對(duì)于疾病的監(jiān)控效果更好,對(duì)于確定治療的終點(diǎn),具有積極的指導(dǎo)作用。
3、定量準(zhǔn)確性
對(duì)于臨床檢測(cè)中定量項(xiàng)目來(lái)說(shuō),試劑盒定量的準(zhǔn)確性是非常重要的,也是評(píng)價(jià)定量試劑盒的一個(gè)重要指標(biāo)之一。衛(wèi)生部每年都會(huì)有2次全國(guó)性的室間質(zhì)評(píng),通過(guò)質(zhì)評(píng)結(jié)果可以很好的看出試劑盒定量的準(zhǔn)確性。 但往往很多時(shí)候,實(shí)驗(yàn)室在選擇試劑的時(shí)候都偏重與過(guò)去的試劑盒比較定量結(jié)果的差異,并以過(guò)去的試劑盒定值作為標(biāo)準(zhǔn)來(lái)參考和評(píng)價(jià)一種新試劑,其實(shí)這種方法不完全可取。不過(guò)可以通過(guò)同時(shí)檢測(cè)衛(wèi)生部的質(zhì)控品來(lái)進(jìn)行比較,這樣才使得兩種試劑在同一客觀標(biāo)準(zhǔn)上進(jìn)行PK,得到合理公平的評(píng)價(jià)。
同時(shí),要驗(yàn)證一個(gè)試劑的定量是否準(zhǔn)確,必一運(yùn)動(dòng)可以采用一個(gè)高濃度樣本,用陰性血清依次進(jìn)行10倍梯度的稀釋,然后選取多家試劑公司的產(chǎn)品進(jìn)行同步檢測(cè)PK,考察各公司試劑對(duì)樣本定值的實(shí)際值與理論值的差異,即可判斷各公司試劑定量準(zhǔn)確與否。
4、有無(wú)內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)
內(nèi)標(biāo)的一個(gè)最主要的作用就是控制假陰性結(jié)果的發(fā)生,但在國(guó)內(nèi)臨床檢測(cè)中往往被忽視了,這主要與兩個(gè)方面有關(guān),一個(gè)是之前國(guó)內(nèi)使用的很多熒光定量PCR儀均為單通道的儀器,無(wú)法進(jìn)行多色熒光的檢測(cè);國(guó)內(nèi)外PCR行業(yè)對(duì)內(nèi)標(biāo)的研究已不是一個(gè)新興課題,目前國(guó)內(nèi)PCR行業(yè)能把內(nèi)標(biāo)做得非常好的科研單位或商業(yè)化的PCR試劑廠家寥寥無(wú)幾,這正體現(xiàn)了這一技術(shù)的難度。
在臨床檢測(cè)中,內(nèi)標(biāo)的作用非常重要。在臨床檢測(cè)過(guò)程中,怎么做到每一個(gè)陰性結(jié)果均為真正的陰性結(jié)果,從而杜絕因擴(kuò)增抑制而出現(xiàn)的假陰性結(jié)果呢??jī)?nèi)標(biāo)的加入就能夠很好的防止假陰性結(jié)果了,加入必一運(yùn)動(dòng)做了一個(gè)樣本,它的目標(biāo)檢測(cè)熒光為陰性,內(nèi)標(biāo)檢測(cè)熒光也為陰性,那么這個(gè)樣本的擴(kuò)增則受到了抑制,該陰性結(jié)果為假陰性,必一運(yùn)動(dòng)必須對(duì)該樣本進(jìn)行復(fù)檢。如果試劑沒(méi)有內(nèi)標(biāo)的話,必一運(yùn)動(dòng)則不能很好的判斷該結(jié)果是否正常?是否可以發(fā)報(bào)告?在發(fā)報(bào)告時(shí),必一運(yùn)動(dòng)無(wú)法保證發(fā)出去的結(jié)果百分之百的準(zhǔn)確;內(nèi)標(biāo)的加入,就可以解決必一運(yùn)動(dòng)這方面的煩惱。目前,衛(wèi)生部的專家也在大力推崇內(nèi)標(biāo)的重要性,也是為了保證檢驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確可靠。
5、線性定量范圍
試劑盒的線性定量范圍指的是試劑盒最低檢測(cè)下限和最高檢測(cè)上限之間的范圍,范圍越寬說(shuō)明試劑盒性能越好。
6、UNG酶防污染體系
PCR反應(yīng)過(guò)程中, 1個(gè)拷貝的DNA經(jīng)過(guò)30個(gè)循環(huán)后,可以增長(zhǎng)到10億個(gè)拷貝的產(chǎn)物DNA, 極微量的PCR 產(chǎn)物污染,就可能造成假陽(yáng)性,因而這是一個(gè)值得特別重視的問(wèn)題。尿嘧啶糖苷酶(UNG)法:將PCR 產(chǎn)物中的dT用dU 代替。這種dU 化的PCR 產(chǎn)物與UNG 一起孵育,因UNG 可裂解尿嘧啶堿基和糖磷酸骨架間的N-糖基鍵,可除去dU 而阻止TaqDNA 聚合酶的延伸,從而失去被再擴(kuò)增的能力。UNG 對(duì)不含dU 的模板無(wú)任何影響,UNG 可從單或雙鏈DNA 中消除尿嘧啶,而對(duì)RNA 中的尿嘧啶和單一尿嘧啶分子則無(wú)任何作用。
此外,試劑的穩(wěn)定性、批間差、溯源性(是否溯源于WHO國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)品)等也都是考察一款試劑盒質(zhì)量重要指標(biāo)。
體外診斷試劑是指采用免疫學(xué)、微生物學(xué)、分子生物學(xué)等原理或方法制備的、在體外用于對(duì)人類疾病的診斷、檢測(cè)及流行病學(xué)調(diào)查等的診斷試劑,包括微生物抗原、人類基因檢測(cè)、腫瘤標(biāo)記物等等。我國(guó)對(duì)體外生物診斷試劑按藥品進(jìn)行管理,對(duì)體外化學(xué)及生化診斷試劑等其他類別的試劑則按醫(yī)療器械進(jìn)行管理。這種分類管理的模式帶來(lái)了一些問(wèn)題:按照《藥品管理法》及藥品 GMP 認(rèn)證的要求,按藥品進(jìn)行管理的體外診斷試劑生產(chǎn)企業(yè)必須通過(guò) GMP 認(rèn)證。部分企業(yè)由于產(chǎn)值較低,企業(yè)發(fā)展規(guī)模有限,根本無(wú)力申報(bào) GMP 認(rèn)證。SFDA 醫(yī)療器械司助理巡視員常永亨介紹說(shuō),自 2005 年起, SFDA 就把體外診斷試劑監(jiān)管當(dāng)作一項(xiàng)重點(diǎn)來(lái)抓,正探索全新的管理模式,已經(jīng)著手起草新的管理辦法,并在網(wǎng)上公開征求各界意見。此次邀請(qǐng)歐盟專家來(lái)華,也正是為了借鑒國(guó)際經(jīng)驗(yàn),做到科學(xué)監(jiān)管,促進(jìn)行業(yè)健康發(fā)展。據(jù)克里斯蒂 ? 塔瑞佳介紹,美國(guó)、加拿大等國(guó)和歐盟一直都將體外診斷試劑歸入器械類管理。歐洲委員會(huì)于 1998 年 10 月 27 日 正式通過(guò)了 98/79/EC 體外診斷器械指令(簡(jiǎn)稱 IVDD 指令),并公告于 1998 年 12 月 7 日 的第 L331 號(hào)歐盟公報(bào)上。根據(jù)公報(bào)的內(nèi)容,歐盟各成員國(guó)必須于 2000 年 6 月 7 日 之前完成執(zhí)行本指令所需要的相關(guān)法規(guī)命令修制定與公告,自 2003 年 12 月起,所有在歐盟各成員國(guó)銷售的體外診斷器械均須依照本指令完成符合性評(píng)價(jià)程序,貼上 CE 標(biāo)記,才能在歐盟上市。根據(jù)歐盟的 IVDD 指令,體外診斷試劑是作為一類特殊產(chǎn)品單獨(dú)管理的,在該指令附錄 Ⅱ 中,目錄 A 和目錄 B 上的品種因風(fēng)險(xiǎn)級(jí)別較高而管理相對(duì)嚴(yán)格。除此之外,歐盟對(duì)其他大部分風(fēng)險(xiǎn)級(jí)別較低的產(chǎn)品實(shí)行自我管理,即制造商建立質(zhì)量管理體系,保留技術(shù)文件,做自我保證聲明,通常無(wú)需政府批準(zhǔn)即可上市。各國(guó)管理體外診斷試劑的具體法規(guī)雖略有不同,但大體上都是根據(jù)風(fēng)險(xiǎn)管理的原則進(jìn)行的,其對(duì)高風(fēng)險(xiǎn)的認(rèn)定也比較一致,因?yàn)楫吘共煌谒幤泛歪t(yī)療器械,其主要應(yīng)用于體外,大部分體外診斷試劑是一種風(fēng)險(xiǎn)程度比較低的產(chǎn)品, 80% 左右的產(chǎn)品不屬于高風(fēng)險(xiǎn)級(jí)別,因此歐盟的這種管理模式相對(duì)容易,管理成本也低。